Per determinar la millor opció per al transport i l’emmagatzematge de l’hidrogen, cal considerar diversos factors: el cabal produït, la distància des de planta de producció fins a punts de consum, la complementarietat d’usos finals, la idoneïtat per al condicionat final i l’ús en els diferents tipus de consums.

Les alternatives que existeixen actualment per al transport i l’emmagatzematge d’hidrogen són l’emmagatzematge físic, hidrogen comprimit, hidrogen liquat o mitjançant materials adsorbents, i l’emmagatzematge químic mitjançant compostos portadors d’hidrogen o hidrurs químics, com l’amoníac o els LOHC (Liquid Organic Hydrogen Carriers), i mitjançant hidrurs metàl·lics. A més, la seguretat és una part fonamental i important rellevància en aquesta secció.